وظايف اصلي معاونت ميراث فرهنگي استان شامل پژوهش، نظارت، حفظ و احياء برگرفته از ماده 3 قانون اساسنامه سازمان ميراث فرهنگي كشور:
1. تهيه و تنظيم و اجراي برنامه‌هاي پژوهشي پيرامون آثار باقي‌مانده از گذشتگان .
2. بررسي و شناسايي محوطه‌ها، تپه‌ها، بناها و مجموعه‌هاي تاريخي و تهيه فهرست جامع از آن‌ها و نقشه باستان‌شناسي استان
3. بررسي‌هاي مردم‌نگاري، پژوهش‌هاي مردم‌شناسي، انسان‌شناسي زيستي و شناخت فرهنگ بومي مناطق مختلف استان.
4. ثبت آثار ارزشمند منقول و غيرمنقول فرهنگي-تاريخي استان در فهرست آثار ملي كشور و فهرست‌هاي ذيربط.
5. تهيه و اجراي طرح‌هاي لازم به منظور حراست، حفاظت تعمير و مرمت و احياء آثار، بناها و مجموعه‌هاي فرهنگي-تاريخي.
6. اظهار نظر در كليه طرح‌هاي عمراني جامع و تفصيلي در رابطه با مناطق فرهنگي و تاريخي و موافقت نهايي درباره محوطه‌ها و بافت‌ها و اماكن فرهنگي-تاريخي ارزشمند در موارد مذكور و جلوگيري از تخريب آن‌ها.
7. تعيين حريم بناها، مجموعه‌ها، محوطه‌ها و تپه‌هاي تاريخي ثبت شده و ضوابط خاص معماري و طراحي داخل حريم.
8. ايجاد مركز اسناد و مدارك ميراث فرهنگي كشور (نظير مجموعه گزارش‌هاي علمي، نقشه‌ها و عكس‌هاي بناها و ...) جهت ارائه خدمات علمي و تحقيقاتي در اين زمينه.
9. همكاري با ساير ارگان‌ها و ادارات در زمينه فعاليت‌هاي مرتبط.